Table 3
Molecular results of IS6110 positive cases
| Case | β actin | IS6110 | Spoligotyping | oxyR | pncA | mtp40 | katG | gyrA | TbD1 int | TbD1 fla | RD9 int | RD9 fla | Genetic group |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| +, positive; −, negative. | |||||||||||||
| 1 | + | + | M bovis | − | − | − | − | + | + | − | − | − | ? |
| 2 | + | + | Incomplete | G | + | − | − | C | + | − | − | − | 1,2 |
| 6 | + | + | − | − | − | − | − | C | − | − | + | − | 1,2 |
| 7 | + | + | M tuberculosis | G | C | + | − | G | − | + | + | − | 3 |
| 9 | + | + | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | ? |
| 11 | + | + | M tuberculosis | − | C | + | − | + | − | + | + | − | ? |
| 15 | + | + | M bovis | − | − | − | − | + | − | − | − | − | ? |
| 20 | + | + | Incomplete | − | − | − | − | − | − | + | + | − | ? |
| 21 | + | + | M bovis | − | − | − | − | C | − | − | − | − | 1,2 |
| 25 | + | + | Incomplete | − | − | − | − | − | − | − | − | − | ? |
| 33 | + | + | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | ? |
| 36 | + | + | Incomplete | − | − | − | − | C | − | − | − | − | 1,2 |
| 37 | + | + | M bovis | A | C | − | T | C | + | − | − | + | 1 |
| 39 | + | + | M tuberculosis | G | C | − | G | C | − | + | − | − | 2 |
| 40 | + | + | M tuberculosis | G | C | + | − | C | − | + | + | − | 2,3 |
| 41 | + | + | Incomplete | G | C | + | − | C | − | + | + | − | 2,3 |
| 44 | + | + | M tuberculosis | G | − | + | − | − | − | + | + | − | ? |
| 47 | + | + | M tuberculosis | G | C | + | G | + | − | + | + | − | 2,3 |
| 48 | + | + | M tuberculosis | G | − | + | G | C | − | + | + | − | 2 |
